国家植物园由国家林业局、中科院、陕西省政府、西安市政府联合共建。规划投资15.5亿元人民币，总面积639平方公里，落差2000多米。自2000年开始建园以来，秦岭国家植物园目前已完成投资约9亿元。

秦岭国家植物园

秦岭国家植物园，位于陕西省西安市周至县境内，由陕西省人民政府、国家林业局、中国科学院、西安市人民政府联合共建的国家级特大型综合植物园。距十三朝古都西安70千米。

秦岭国家植物园距市中心60千米， 总面积639平方千米。地理区位为东经108°13′—108°29′、北纬33°43′—34°04′之间，属暖温带大陆性山地气候。年平均降水800—900毫米，年平均温度8℃—10℃。兼具物种保育、科学研究、公众教育、生态旅游四项功能。

秦岭国家植物园落差2000多米，是世界上面积最大、植被分带最清晰、最具自然风貌的植物园，也是中国第一个国家级植物园。

1998年6月，植物园开始筹建，在中科院西安分院副院长沈茂才研究员承担的“秦巴山区优势生物资源综合开发利用与保护”课题的基础上，2000年06月，陕西省长办公会议决定建设秦岭植物园。

秦岭国家植物园总投资达15.5亿人民币，分别由陕西省人民政府、国家林业局、中国科学院和西安市人民政府按照1：1：1：0.5的比例筹措建设资金，重点完成基础设施建设任务，为秦岭国家植物园建设奠定基础。为了使资金尽快得到周转，植物园项目筹备组还向亚洲银行申请了3500万美元贷款，向GEF申请1000万美元赠款。最终，秦岭国家植物园成为亚洲银行在中国扶持的第一个生物多样性保护项目，获得了4000万美元贷款，并获得500万美元全球环境基金赠款。

2001年02月，陕西省人民政府批准建设秦岭植物园，规划面积458平方千米，建设植物迁地保护区、动物迁地保护区、生物多样性就地保护区以及农业观光和生态度假区等四个区，是集生物多样性保护、科学研究、科普教育和生态旅游为一体的世界上最大的植物园。

2001年11月，陕西省政府常务会议决定成立陕西省秦岭植物园，同年12月，陕西省编委批复成立陕西省秦岭植物园，加挂陕西省秦岭植物研究院牌子，为陕西省政府直属正厅级事业单位。

2005年08月，秦岭植物园划入陕西省林业厅代管。

2006年10月10日，在北京召开了陕西省政府、国家林业局、中国科学院、西安市政府联合共建第一次会议，将名称正式确定为秦岭国家植物园。

2007年05月30日，陕西省政府、国家林业局、中国科学院、西安市政府联合在周至县集贤镇举行秦岭国家植物园奠基仪式，拉开了秦岭国家植物园建设的大幕。

2012年，重点建设项目共10个，总投资13.5亿。

2014年10月21日上午，秦岭国家植物园与中国银行陕西分行，在西安举行全面业务合作协议签字仪式。中国银行十亿授信秦岭国家植物园配套设施建设及其相关产业发展。

截至2017年初，秦岭国家植物园已完成投资约9亿元，建成以“湿地奇草、花海异木、山居峡谷、小径民宿”为主要内容的智慧植物园，完成了海棠园、竹亚科园、蔷薇园等8个专科专类园和花园沟花卉引种区等18个项目。3000平方米标本馆、6000平方米温室馆、1400平方米VR智能科普馆、大门广场等11个项目开工建设，完成了十余个民宿改造设计项目以及金牛坪、栗子坪、九斤坪、殿镇新街4个风情小镇的建设规划。

2018年04月13日，陕西师范大学与秦岭国家植物园、陕西省社会科学界联合会等6家单位联合共建的教学实践基地和青少年科普教育基地揭牌仪式在秦岭国家植物园举行。

2019月01月09日，秦岭国家植物园园艺中心在园艺中心办公楼举行了揭牌仪式。  

2019年03月09日，由秦岭国家植物园主办、多家单位协办的秦岭国家植物园暨第二届秦岭植树季开幕，来自全国各地近3000名游客见证开幕仪式并参加活动。